Az EÜKB kiképzési és felkészítési tevékenysége felöleli a HM és az MH hivatásos, szerződéses és közalkalmazotti állomány egészségügyi alap-, szakkiképzésének és felkészítésének megterverzését és végrehajtását, az MH által válságkezelő, békefenntartó műveletekben felajánlott erők egészségügyi kiképzését, felkészítését, az MH egészségügyi szakállományának előmeneteli képzésének tervezését, szervezését és végrehajtását.

Az egészségügyi kiképzések célja:

A HM és MH személyi állomány alap-, és szakkiképzése a beosztásához előírt követelményszint elérése érdekében
A szövetségi és a nemzetközi szerepvállalásban résztvevő személyi állomány felkészítése a műveleti területen történő feladatellátás során keletkező harci és nem harci eredetű sérülések szakszerű ellátására
A meglévő és jóváhagyott kiképzési terveknek megfelelően az alább felsorolt célcsoportok tanfolyam jellegű kiképzése
MH hivatásos és szerződéses állomány alap „ön- és kölcsönös segélynyújtás” képzésének végrehajtása
Nem egészségügyi beosztású gépjárművezető és sebesültszállító legénységi szerződéses állomány egészségügyi kiképzése
MH speciális szakbeosztású állomány (mentőbúvár, tűzszerész) speciális egészségügyi kiképzése
Egészségügyi szakbeosztású hivatásos és szerződéses állomány egészségügyi szakkiképzése
Nem katonai tanintézetekben végzett egészségügyi beosztású hivatásos és szerződéses állomány szakmai szakkiképzésének végrehajtása
MH egészségügyi beosztású hivatásos és szerződéses tiszti és tiszthelyettesi szakállomány előmeneteli szakmai továbbképzésének végrehajtása
NATO és EU reagáló- és készenléti erőibe felajánlott kötelékek és törzstisztek egészségügyi felkészítése
Válságkezelő és békefenntartó műveletekbe felajánlott erők egészségügyi felkészítése
A különböző NATO parancsnokságokra és törzsekbe vezényelt hivatásos és szerződéses tiszt -, tiszthelyettesi állomány egészségügyi felkészítése

A NATO Különleges Műveleti Alaptanfolyam (NKMA) keretében egészségügyi specialista (SF 18-DELTA) szakkiképzés feltételeinek megteremtése, a próbaképzés és a nemzetközi képzés előkészítése, végrehajtása
Az egészségügyi felkészítés és kiképzés további feladatai
Egészségügyi vezetői állomány éves szakmai felkészítése (szakorvosi, főszakorvosi összevonások)
Pályakezdő orvosok, HM és MH Egészségügyi szakállomány továbbképzésének koordinálása (egészségügyi biztosítás, ellátás, egészségvédelem, egészségügyi anyagellátás)
Közalkalmazott orvos és szakdolgozó állomány továbbképzése